Ważne jest regularne czyszczenie kulek filtrujących basen, aby zapobiec ich zatykaniu i nieskuteczności. W zależności od wielkości basenu i intensywności jego użytkowania, może zaistnieć potrzeba czyszczenia kulek FilterBall raz w tygodniu lub raz w miesiącu. Aby oczyścić kulki FilterBalls, po prostu wyjmij je z filtra i opłucz wężem.
Można je również namoczyć w wiadrze z wodą z mydłem, aby dokładniej je wyczyścić. Pamiętaj, aby dokładnie wypłukać mydło przed ponownym włożeniem kulek do filtra.